###
DOI:
上海农业学报:2020,36(6):72-78
本文二维码信息
码上扫一扫!
猪ZFAND6基因克隆、序列分析及其多态位点检测
Cloning, sequence analysis and SNP detection of pig ZFAND6 gene
摘要
图/表
参考文献
相似文献
本文已被:浏览 184次   下载 133
    
中文摘要: 为了丰富猪ZFAND6基因研究的基础数据以及多态性分析,以‘申农猪’肝脏组织为材料,采用RT-PCR和测序技术对猪ZFAND6基因CDS区进行扩增,使用ProtParam、PredictProtein、SWISS-MODEL等软件进行序列分析,并采用RFLP-PCR方法检测猪ZFAND6基因g.2395C>T位点和g.15060A>G位点在不同猪群体中的多态性。结果表明:获得猪ZFAND6基因长度为1097bp,包括CDS区624bp,共编码208个氨基酸残基,(A+T)含量高于(G+C)含量。猪ZFAND6蛋白为酸性蛋白质,氨基酸残基中Ser(15.38%)、Val(8.17%)及Gln(7.21%)的频率较高,属不稳定类和可溶性蛋白。猪ZFAND6蛋白主要由α-螺旋、β折叠和无规卷曲构成,分布在细胞质、线粒体、溶菌体和内质网比例分别为65%、10%、10%和15%,具有ZnF-A20结构域和ZnF-AN1结构域。猪ZFAND6蛋白氨基酸序列在不同物种之间同源性较高,与牛、羊在系统发育树中距离最近。ZFAND6基因g.2395C>T和g.15060A>G两个SNP位点在5个猪群体内表现出不同的遗传特点。在‘长白猪’群中未检出g.2395C>T位点的TT型和g.15060A>G位点的不利基因型GG型,并且GG型在‘杜洛克猪’‘大白猪’‘申农猪’和‘梅山猪’群体中比例低。
Abstract:
keywords:
文章编号:     中图分类号:    文献标志码:
基金项目:
Author NameAffiliation
  
引用文本: